Saviez-vous que les couleurs jouent un rôle clé dans l’analyse cellulaire ? Cette semaine, partons à la découverte de la cytométrie ! Un épisode haut en couleur avec Olivier Molendi-Coste, Responsable scientifique et technique de la plateforme en cytométrie de l’Institut Pasteur de Lille. La cytométrie est une technique qui permet de déduire la carte d’identité des cellules à partir de faisceaux lumineux en vue de mieux comprendre leur fonctionnement et comment elles réagissent aux traitements médicaux. « En cytométrie, on peut aider la science à avancer. J’ai toujours été attiré par la nutrition et les phénomènes de société comme le diabète et l’obésité. Puis la recherche m’a dirigé vers la cytométrie pour étudier les phénomènes immunitaires, et ça m’a beaucoup plu ! », explique Olivier. Olivier déborde de passion pour son métier, et ça s’entend ! Aux utilisateurs qu’il forme sur les outils de cytométrie, il rappelle l’importance de clarifier les hypothèses de recherche dès le départ. « Comme disent les Anglais : garbage in, garbage out. Si on arrive avec un mauvais prélèvement ou un mauvais marquage, on ne ressortira que de mauvais résultats. » L’expert se veut néanmoins rassurant sur l’apprentissage de cet outil complexe : « C’est une fois que l’on a fait toutes les erreurs possibles que l’on comprend le cytomètre. Il n’y a pas de question bête. » Préparez-vous à être transportés dans un univers coloré et lumineux où les cellules sont les stars du spectacle et où les chercheurs sont les maîtres de cérémonie. Bonne écoute !

Depuis 2022, le bâtiment ONCOLille du CHR regroupe les chercheurs sur tous les cancers afin de faciliter les collaborations. Cette semaine, Marie-José Tu-Anh Truong Maurice nous emmène à l’échelle cellulaire pour parler du cancer du poumon. À l’échelle de la cellule, Marie-José étudie les récepteurs impliqués dans certains cancers du poumon : « 3% des cancers du poumon non à petites cellules présentent des mutations activatrices du récepteur MET. » Il s’agit donc de comprendre comment la mutation du récepteur peut transformer une cellule bénigne en tumeur.  Pour cela, Marie-José travaille sur des modèles cellulaires pulmonaires développés au laboratoire de culture cellulaire. « Ce sont des cellules cancéreuses donc on ne peut pas les maintenir n’importe où. On les conserve dans des incubateurs à 37 degrés et 5% de CO2, des conditions proches de celles du corps humain. »   Après avoir longtemps dirigé le service de formation de l’Institut Pasteur de Lille, Marie-José a souhaité revenir à ses premiers amours en reprenant ses activités de recherche. Une passion qui l'anime et qu'elle fait rayonner : « Faites de la recherche ! C’est un métier passionnant, on se questionne toujours et on avance toujours. » 

Saviez-vous que la 3e cause de mortalité dans le monde s’appelait BPCO ? Largement méconnue, cette pathologie est principalement causée par l’exposition à la fumée de cigarette. Explorons comment avance la recherche sur ce sujet avec Muriel Pichavant, Chargée de recherche Inserm et Codirectrice de l’équipe de recherche « Infections opportunistes, immunité, environnement et maladies pulmonaires » au sein du centre d’infection et d’immunité de Lille. Le constat est sans appel : la BPCO est une maladie aussi répandue que méconnue. « En France, il y a 3,5 millions de cas diagnostiqués, mais on estime que plus de 60% des malades ignorent qu’ils portent cette pathologie. Le problème, c’est que cette pathologie évolue par paliers. Ca commence par des essoufflements, mais les malades s’y habituent donc souvent la maladie est diagnostiquée très tard, lorsque les personnes ne savent plus monter les escaliers. » La fumée de cigarette est impliquée dans 80% des BPCO, qu’il s’agisse de tabagisme actif ou passif. Dans son laboratoire, Muriel utilise donc des cigarettes de recherche pour mimer l’aspiration de fumée avec des seringues et stimuler les cellules immunitaires. Avec un objectif précis : trouver des bio-marqueurs qui permettront de détecter la BPCO bien avant les formes graves, et identifier des pistes thérapeutiques. « Les patients BPCO sont aujourd’hui uniquement diagnostiqués sur une épreuve de souffle, mais nous cherchons d’autres marqueurs pour adapter le diagnostic. » Muriel aime expliquer son propre intérêt pour les pathologies du poumon par son propre vécu. « Étant asthmatique moi-même, je voulais comprendre ce qui m’arrivait et trouver un médicament pour me sentir mieux. Après avoir travaillé sur l’asthme, je suis partie aux Etats-Unis travailler sur la pollution environnementale, avant de me spécialiser sur la BPCO. » En parallèle de son travail de chercheuse, Muriel fait des conférences et présente son métier dans des associations pour montrer que le métier de scientifique est accessible aux femmes, et cela à tous les échelons. Bonne écoute ! 

Saviez-vous qu’une brûlure de la peau se régénérait 60% plus rapidement en journée que la nuit ? La chercheuse Alicia Mayeuf-Louchart nous en dit plus. Au niveau cellulaire, l’expression des différents gênes et protéines suit un rythme circadien qui influence le comportement des cellules au cours de la journée. Décrypter le fonctionnement de cette horloge interne permet donc d’améliorer les thérapies. « Nous cherchons à comprendre comment l’horloge des cellules souches musculaires influence leur capacité à régénérer nos fibres musculaires lorsqu’on se blesse. », résume Alicia. Les greffes sont un enjeu majeur de ce champ de la recherche. En effet, il est aujourd’hui prouvé que les muscles se régénèrent mieux en journée que la nuit. Alicia travaille donc sur des cultures de cellules souches musculaires de jour comme de nuit. «Comprendre comment fonctionne l’horloge biologique de ces cellules nous permettra de réaliser les greffes de cellules au meilleur moment de la journée », affirme la chercheuse. Marraine du programme For Girls and Science organisé par la Fondation L’Oréal, Alicia s’engage en parallèle de son activité pour promouvoir la science auprès des lycéennes et leur montrer qu’il existe de nombreuses carrières scientifiques auxquelles elles peuvent aspirer.  Bonne écoute !

Saviez-vous qu’il existe un lien entre notre flore intestinale et notre système immunitaire pulmonaire ? François Trottein est un grand curieux. Passionné par les questions qui touchent au vivant, il est aujourd’hui Directeur de recherche CNRS spécialisé en infections respiratoires (grippe, pneumocoque, covid…) à l'Institut Pasteur de Lille. Quel rôle joue le microbiote intestinal sur la survenue des infections et leur sévérité ? « On sait depuis une vingtaine d’années que le microbiote peut influencer le système immunitaire, et éduque certaines cellules immunitaires du poumon pour lutter contre les agents infectieux », explique François. Néanmoins, une question se pose : une infection respiratoire virale sévère comme la grippe peut-elle perturber les fonctions du microbiote intestinal et favoriser le risque de surinfection bactérienne ? La réponse est oui. Au cours de la pandémie de Covid-19, François s’est engagé au sein de la Task Force de l’Institut Pasteur de Lille. « On a été les premiers à montrer que le virus du SARS-CoV-2 induisait une dysbiose (altération fonctionnelle du microbiote intestinal). On a constaté qu’il y avait une association entre une certaine bactérie et la sévérité de la maladie. D’où l’idée de travailler sur cette dysbiose pour améliorer la pathologie, notamment dans le cas du Covid long. » Si le microbiote se forme surtout à la naissance, il est possible de l’entretenir à l’âge adulte pour le rendre plus résistant. « Le microbiote intestinal, c’est un ami qu’il faut respecter. Plus on vieillit, plus notre microbiote est altéré donc il faut contrecarrer tout ça via son alimentation et en faisant de l’exercice. » Un épisode qui respire la passion !

L’alimentation de demain sera-t-elle meilleure que celle d’hier ? Pourquoi manger est un acte collectif ? Autant de questions auxquelles le Docteur Jean-Michel Lecerf nous apporte une réponse. « Il faut réaffirmer que manger nous fait du bien. Aujourd’hui, nous sommes envahis de rumeurs et d’angoisses mais globalement notre alimentation est sûre, saine et variée. Donc il faut rassurer », déclare le fondateur du service Nutrition et Activité physique de l’Institut Pasteur de Lille. Manger ne sert pas seulement à nourrir, mais aussi à réjouir : « Le plaisir est un bon allié. Il faut qu’on ré-apprenne à manger des aliments riches, en petite quantité. Ça fait partie de notre culture et de notre patrimoine. Gardons une relation affective, tendre, conviviale avec les aliments. » Il faut dire que ce vétéran de la nutrition n’en est pas à son premier combat. Celui qui a mis au point la première margarine française riche en Oméga 3 insiste sur l’importance de se réunir autour de la table du repas : « C’est notre humanité, et c’est au service d’une bonne nutrition. Quand on mange à table avec les autres, il y a une régulation qui se fait, et puis c’est un bonheur simple. L’acte culinaire est un acte de don ! La cuisine, c’est aussi quelque chose qu’on offre aux autres. » Un épisode qui donne envie de se réunir avec ses proches autour d’un bon repas.

Comment mettre la génomique au service de la recherche ? David Hot, coresponsable de la plateforme technologique Go@L (Genomic at Lille) nous répond. Depuis 2001, l’ingénieur en biotechnologies s’attèle à utiliser son expertise technique sur la génomique au service des projets de recherche d’autres laboratoires. « Nous étudions précisément comment les molécules d’ADN et d’ARN réagissent aux agressions extérieures, explique David. Pour cela, nous travaillons à l’échelle du génome entier pour regarder toutes les modifications qui peuvent survenir. Ça représente énormément de molécules ! » Parmi les travaux en cours de David et son équipe, une étude porte sur les mutations du virus SARS-CoV-2 afin de comprendre comment le virus évolue au sein d’une personne. « Lorsque le virus mute, l’individu se retrouve en présence de 2 virus dans son système immunitaire : la version d’origine et la version mutée. Ce qui m’intéresse, c’est de comprendre comment les nouveaux variants émergent, et s’ils émergent différemment d’une personne à une autre suivant son état de santé. » L’évolution de la technologie en génomique sur les 20 dernières années est impressionnante : « Séquencer le génome humain en entier, c’était un projet international énorme qui a pris plus de 10 ans et coûté 3 milliards d’euros. Avec les technologies actuelles, on peut désormais reséquencer le génome avec le même niveau de précision en 2-3 jours, pour seulement quelques milliers d’euros. Le pas technologique est énorme ! Et ça va continuer de s’améliorer. Demain, le séquençage de génome va probablement devenir quelque chose de courant, notamment dans le contrôle qualité au service d’une meilleure nutrition. »

Antonia Gasch Illescas est médecin de santé publique, responsable du projet PrevenDiab, une étude initiée par le centre national PreciDiab et l'Institut Pasteur de Lille afin de mieux prévenir le diabète. Alors que 4 millions de Français souffrent de diabète, l’étude PrevenDiab s’intéresse à la prévalence du diabète dans la région du Nord et aux facteurs de risque modifiables, notamment chez la population précaire. Parmi les principaux leviers pour lutter contre le diabète : améliorer sa nutrition,  pratiquer une activité physique régulière, et réguler son niveau de stress. Les premiers résultats de l’étude sont alarmants : « Le taux de diabète est plus élevé dans notre région que la moyenne nationale. Au total, 25% de la population du Nord a une glycémie altérée. » Un risque accru de 33% chez les personnes précaires. Malgré cet état des lieux qui fait froid dans le dos, il est difficile de ne pas percevoir une lueur d’espoir dans l’oeil d’Antonia. Pour cette passionnée de la prévention et d’épidémiologie, les choses avancent dans le bon sens : « Je suis très contente du déroulement du projet, les gens sont très volontaires pour participer. Quant à moi, j’ai l’honneur de mettre mon grain de sable pour faire prendre conscience de l’importance de la prévention. Je fais ce que je peux pour qu’on continue d’investir dans cette partie de la médecine qui est parfois oubliée. »

Joel Haas nous accueille cette semaine dans le laboratoire des maladies métaboliques et cardiovasculaires de l’Institut Pasteur de Lille. Le chercheur nous parle de son sujet de prédilection : la stéatose hépatique non alcoolique - aussi connue sous le nom de maladie de NASH. Cela fait longtemps que Joel travaille sur le rôle du foie dans la régulation. Un territoire de recherche qui devient de plus en plus préoccupant : « Aujourd’hui, avec la prévalence de l’obésité et du diabète et leurs complications, la maladie de NASH est la maladie du foie la plus fréquente au monde. 30% de la population mondiale souffre de problèmes de gras qui s’installe dans le foie », décrit Joel. Le chercheur s’intéresse aux mécanismes cellulaires qui conduisent à l’inflammation du foie. « Plus le gras s’installe dans le foie, plus on risque des complications qui peuvent engendrer d’autres maladies. Je cherche donc les cellules qui auraient un fonctionnement altéré pouvant engendrer une inflammation. » Un sujet d’autant plus important que le seul moyen de faire régresser la maladie est aujourd’hui de réguler fortement son alimentation. Arrivé en 2013 au sein de l’Institut Pasteur de Lille, Joel éprouve une certaine fierté sur les recherches de son équipe : « Dans nos études de cohorte, on a su montrer qu’il existe un mécanisme dans la progression de la maladie. On arrive à faire des choses qui sont très relevantes dans la recherche appliquée. On se sent utile ! » Bonne écoute !

Marine Leblanc est médecin au centre de vaccinations internationales et de médecine du voyage de l’Institut Pasteur de Lille. Dans cet épisode, elle nous explique comment elle accompagne les voyageurs avant leur grand départ. « Le profil des voyageurs est très divers, assure Marine. On peut avoir des gens qui viennent pour un voyage familial classique, d’autres qui envisagent un tour du monde ou qui partent faire de l’humanitaire, ou bien qui travaillent  à l’étranger dans des pays tropicaux… » Afin d’apporter aux voyageurs une vision globale des risques sanitaires de leur destination, Marine épluche quotidiennement les alertes sanitaires et tient à jour la plateforme d’information METIS. « Il y a 2-3 ans, le virus Zika était très actif en Amérique du Sud. Depuis, c’est retombé. En ce moment, la dengue reprend de l’ampleur, ainsi que les épidémies de fièvre jaune. Ça dépend des saisons » résume Marine, avant de confier qu’il subsiste une part d’incertitude : « C’est toujours délicat de déclarer qu’une épidémie est terminée. À partir de quel moment considère-t-on qu’il n’y a plus de risque ? ». La médecin qui a monté un centre de vaccination contre le Covid en sait quelque chose. La consultation médicale est une étape non négligeable avant un voyage lointain. « C’est important de savoir où on va mettre les pieds pour partir plus sereinement et passer un meilleur séjour. On observe les antécédents des voyageurs et on les informe sur les différents vaccins qui pourraient être réalisés. Mais on n’impose rien. Chaque voyageur a sa propre perception des risques. Certains prennent toutes les précautions possibles, d’autres ne font que les vaccins obligatoires. Dans tous les cas, on renforce certains messages pour qu’ils partent préparés. » Bonne écoute !