Obligatoire lors de la majorité des naissances, le contrôle de filiation repose sur la comparaison du génome du poulain et de ses parents. Un changement de technologie utilisée pour cette comparaison est attendu prochainement, avec l'utilisation de marqueurs génétiques SNP (Single Nucleotid Polymorphism) en remplacement des marqueurs microsatellites (MS) qui deviennent obsolètes. Obtenus après analyse en laboratoire de la prise de sang, grâce à la puce SNP ou puce ADN (à ne pas confondre avec la puce d'identification), les marqueurs SNP donnent des informations sur des milliers de points du génome du cheval.

Dans ce podcast, Armelle Govignon, ingénieure de recherche à l'IFCE, présente le fonctionnement de la puce SNP développée pour l'ensemble des races françaises (puce "GENOFIL 1" de 60 0000 SNP) utilisée dans le cadre du projet Génomique Filière. Elle explique comment sera gérée la transition entre les deux technologies pour le contrôle de filiation grâce à la technique dite "d'imputation" validée par des travaux de recherche.

Elle développe aussi toutes les valorisations possibles des données génomiques, les marqueurs SNP permettant de travailler sur de multiples objectifs : gènes d'intérêt connus (maladies, performances, robes), calcul d'indices génomiques, production de coefficient de consanguinité et d'indicateurs de variabilité génomiques, découverte de nouveaux gènes majeurs etc..

Pour aller plus loin :
• Webconférence - Génomique et sélection : les gènes d’intérêt
• Vidéo - Session génétique JSIE
• Fiches équipédia - Génétique
• Webconférence - Le contrôle de filiation : principes et perspectives

• Webconférence - Projet génomique filière : préparons l'avenir

Si vous souhaitez en savoir plus sur le sujet, rendez-vous sur notre site internet equipedia.ifce.fr où vous trouverez tous les travaux de nos experts. Vous pouvez aussi nous rejoindre sur notre groupe Facebook équipédia, sciences et innovations équines pour plus de contenus. Pour ne manquer aucun épisode, abonnez-vous, partagez, commentez et n'hésitez pas à laisser 5 étoiles sur Apple Podcasts et Spotify.

Hébergé par Ausha. Visitez ausha.co/politique-de-confidentialite pour plus d'informations.